Добавил:
kiopkiopkiop18@yandex.ru Вовсе не секретарь, но почту проверяю Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

2 курс / Биохимия / Лекции_по_общей_биохимии_Для_студентов_медицинских_вузов_Тимин_О

.pdf
Скачиваний:
3
Добавлен:
23.03.2024
Размер:
85.9 Mб
Скачать

Аминокислоты ибелк и

10

 

 

Ксвойстпептиднойсвязиотносятсяам:

 

1. Трансположение заместрадикал( )аминтелейпоотношениюкислотв

C-N связи.

2.

Копланарность

 

 

 

 

Всеатомы,входящие

впептиднгруппу, ю

находятводнпло,прийсэтякатостим

о-

мы "Н" и "О" распоразныеложеныст пронытптиднойсвязи

 

.

3.

Наличие кетоформы и енольной формы.

 

 

4Способность. кобразованию

дводородныхухсвязей

. Атомыкислородаводорода,вх

о-

дящиевпептиднгруппу, ю

обладаютспособнобразовыватьдородныестьюсвязи

 

 

атомамикислородаво ругихпептидныхгрупп.

 

 

 

5Пептидная. связьимеетчас ично

характер двойной связи.Еедлинаменьше,чем

 

одинарнойсвязи,онаявляется

жесткой структурой, и вращениевок

ругнее

затруднено.

Но таккак , кромепептидной

, вбестьлкеидругиесвязи,цепочкааминокислотсп

 

о-

собнавращатьвокругосновнойоси,чтопридябелкаметзличнуюконформациюпр(

 

о-

странрасположтвеннатомов). ение

 

 

 

biokhimija.ru

Тимин О.А. Лекции по общей биохимии (2018г)

11

 

 

 

 

 

 

Ф У Н К Ц И И Б Е Л К О В

1. Структурная:

o в соединительной ткани и коже – коллаген, эластин, кератин,

o межклеточное пространстве формируют протеогликаны, коллаген, эластин,

oпостроение мембран и формирование цитоскелета (интегральные, полуинтегральные

иповерхностные белки) – спектрин (поверхностный, основной белок цитоскелета эритроцитов), гликофорин (интегральный, фиксирует спектрин на поверхности),

oпостроение органелл – рибосомы.

2.Ферментативная:

Все ферменты являются белками, хотя имеются экспериментальные данные о существовании рибозимов, т.е. рибонуклеиновой кислоты, обладающей каталитической активностью.

3. Гормональная:

Регуляция и согласование обмена веществ в разных клетках организма – такие гормоны как инсулин и глюкагон являются белками, все гормоны гипофиза являются пептидами или небольшими белками.

4. Рецепторная:

Избирательное связывание гормонов, биологически активных веществ и медиаторов на поверхности мембран или внутри клеток.

5. Транспортная:

Перенос веществ в крови – липопротеины (перенос жира), гаптоглобин (транспорт гема), трансферрин (транспорт железа) или через мембраны – Na++-АТФаза (противоположный трансмембранный перенос ионов натрия и калия), Са2+-АТФаза (выкачивание ионов кальция из клетки).

6. Резервная:

Производство и накопление в яйце яичного альбумина как депо для развития цыпленка. У животных и человека таких специализированных депо нет, но в некотором смысле в каче-

стве депо выступают белки мышц, лимфоидных органов, эпителиальных тканей и пече-

ни. Эти белки мобилизуются при длительном голодании. 7. Питательная:

Белки грудного молока, использование организмом тканевых белков при голодании. 8. Защитная:

Защитную функцию, предупреждая инфекционный процесс и сохраняя устойчивость организма, выполняют иммуноглобулины крови, факторы системы комплемента (пропердин), при повреждении тканей работают белки свертывающей системы крови - например, фибриноген, протромбин, антигемофильный глобулин. Механическую защиту в виде слизистых и кожи осуществляют коллаген и протеогликаны.

К защитной функции также можно отнести поддержание постоянства коллоидноосмотического давления крови, интерстиция и внутриклеточных пространств. Белковая буферная система участвует в регуляции кислотно-щелочного состояния.

У Р О В Н И О Р Г А Н И З А Ц И И Б Е Л К О В О Й С Т Р У К Т У Р Ы

Белок – это последовательность аминокислот, связанных друг с другом пептидными связями. Если количество аминокислот не превышает 10, то новое соединение называется пептид; если от 10 до 40 аминокислот – полипептид, если более 40 аминокислот – белок.

Линейная молекула белка, образующаяся при соединении аминокислот в цепь при помощи пептидных связей, является первичной структурой. Образно ее можно сравнить с обычной нитью, на которую навешено до нескольких сотен бусинок двадцати различных

Аминокислоты ибелк и

 

 

12

 

 

 

 

цветовпо(числуаминокислот).

Строеами,ихнпиеокислот

оследовательностьисоотнош

е-

ниев

первичной структуреопределядальнейшееповмолтдение: способностькулы

 

з-

гибаться,сворачиваться,формтеилииныесвязировавнусебя.тьри

 

 

 

 

Формымоле кулы,создаваемые

присвертывании,последовательномогутпр нимать

 

 

вторичный, третичный и четвертичный уровень организации.

На уровне вторичной структуры белковые "бусы"

способны укладываться в виде спи-

рали (подобно дверной пружине)

и в виде складчатого слоя,

когда "бусы"

уложены змейкой

и удаленные части "бус" оказываются рядом.

Укладка белка во вторичную структуру плавно переходит в формирование третичной структуры. Трестичнаяруктура – это отдельные глобулы, в которых белок уложен компактно, в виде трехмерного клубка.

Некоторые белковые глобулы существуют и выполняют свою функцию не поодиночке, а группами по две, три и более штук. Такие группы образуют четвертичную структуру белка.

П Е Р ВСИТ ЧР УНКАТЯУ Р А

Это последовательность аминокислотвполипептидцепи.Учи, всиываянтезеой

белковприниучаст20миаетнокислот

исреднийбелоксодержит500аминокислотных

ос,татков

можно говорить оневообразимомколичестве

потенциально возможныхбелков.

Ворганизме

человекаобнаружено

около100тысячразличныхбелков.

 

ПервичнаяструктурабелковзадаетсяпоследовательннуклеотидДНК остьюв

. Выпа-

дение,вст,зануклеотиаминменавкапризменеводитсоиюкислотногослед, тава

 

о-

вательно,структурысинтезируемогобелка.

 

 

На,пример рисерповидноклеточнойанемииположении6

β-цепигемоглобинапр

о-

исходитзаменаГлуВал.ЭтоприводитксинтезуHbS

– такогогем,котглворыйбина

 

biokhimija.ru

Тимин О.А. Лекции по общей биохимии (2018г)

13

 

 

 

дезоксиформе полимеризуется и образует кристаллы. В результате эритроциты деформируются, приобретают форму серпа (банана), теряют эластичность и при прохождении через капилляры разрушаются. Это в итоге приводит к анемии, снижению оксигенации тканей и их некрозу.

Если изменение последовательности аминокислот носит не летальный характер, а приспособительный или хотя бы нейтральный, то такой белок может передаться по наследству и остаться в популяции. В результате возникают новые белки и новые качества организма. Такое явление называется полиморфизм белков.

К примеру, возникновение групп крови АВ0 связано с тремя вариантами фермента, осуществляющего присоединение к олигосахариду мембран эритроцитов либо N-ацетилгалактозы (группа А), либо галактозы (группа В), либо фермент не присоединяет дополнительные сахаридные группы (группа 0).

Последовательность и соотношение аминокислот в первичной структуре определяет формирование вторичной, третичной и четвертичной структур.

В Т О Р И Ч Н А Я С Т Р У К Т У Р А

Вторичная структура – это способ укладки полипептидной цепи в упорядоченную структуру, при которой аминокислоты взаимодействуют через пептидные группы.

Формирование вторичной структуры вызвано стремлением пептида принять конформацию с наибольшим количеством водородных связей между пептидными группами. Вторичная структура определяется:

o устойчивостью пептидной связи, o подвижностью С-С связи,

o размером аминокислотного радикала.

Все это вкупе с аминокислотной последовательностью приводит к строго определенной конфигурации белка.

Можно выделить два возможных варианта вторичной структуры: α-спираль (α−структура) и β-структура (β-складчатый слой). Вторичная структура образуется при участии только водородных связей между пептидными группами: атом кислорода одной группы реагирует с атомом водорода следующей, одновременно кислород этой пептидной группы связывается с водородом еще одной и т.д. В одном белке, как правило, одновременно присутствуют α-спираль и β-структура. В глобулярных белках преобладает α-спираль, в фиб-

риллярных β-складчатый слой.

α П И Р А Л Ь

Правозакрученная спираль, образуется при помощи водородных связей между пептидными группами 1-го и 4-го, 4-го и 7-го, 7-го и 10-го и так далее аминокислотных остатков.

Формированию спирали препятствуют пролин и гидроксипролин, которые обусловливают “перелом” цепи, ее резкий изгиб.

Высота витка составляет 0,54 нм и соответствует 3,6 аминокислотных остатков, 5 полных витков соответствуют 18 аминокислотам и занимают 2,7 нм.

β К Л А Д Ч А Т Ы Й СЛОЙ

При формировании β-структуры аминокислоты одной белковой цепи взаимодействуют друг с другом при помощи водородных связей между пептидными группами. В этом спо-

собе укладки белковая молекула лежит "змейкой", удаленные отрезки цепи оказываются поблизости друг от друга. В результате пептидные группы ранее удаленных аминокислот белковой цепи оказываются рядом и способны взаимодействовать при помощи водородных связей.

Аминокислоты ибелк и

14

 

 

Ориентация реагирующих участков может быть параллельна (когда соседние цепи идут

в одном направлении)

или антипараллельна (цепи идут в противоположном направлении)

.

 

Поднаправлениембелкцепиповойимаютаправлениеот

 

 

N-конца(

N-концевой

 

 

аминокислоты)

C-концуС(

-концевойаминокислоте).

 

 

 

 

 

Таких взаимодействующих другсдругом

участководногобелка

можетбыоть

двух до

пяти.

 

 

 

 

 

 

 

 

Т Р Е ТСИТЧР НУ КАТЯУ Р А

 

Трестичнаяруктура

– этоукладкаполипептиднойцепи

в глобулу ("клубок"). Четкой

границымеждувторичнойтретичнструктурамипровестинельзяй,

 

воснове третичной

структуры лежат стерические взаимосвязимеждуаминокислота,отстоящими

далеко друг

отдругавцепи.Благодарятретичнструктурепроисходитещейболеекомпактное

форми-

рованцеп. ие

 

 

biokhimija.ru

Тимин О.А. Лекции по общей биохимии (2018г)

15

 

 

 

Наряду с α-спиралью и β-структурой в третичной структуре обнаруживается так называемая неупорядоченная конформация, которая может занимать значительную часть молекулы. В разных белках наблюдается разное соотношение типов структур. Например, инсулин содержит 52% α-спирали и 6% β-структуры, трипсин – 14% α-спирали и 45% β-структуры.

Аминокислоты принимают участие в формировании третичной структуры, образуя связи между своими функциональными группами (радикалами):

o водородные – между ОН-, СООН-, NH2-группами радикалов аминокислот, o дисульфидные – между остатками цистеина,

o гидрофобные – между остатками алифатических и ароматических аминокислот,

o ионные – между СООН-группами глутамата и аспартата и NH2-группами лизина и аргинина,

oпсевдопептидные – между дополнительными СООН-группами глутамата и аспартата

идополнительными NH2-группами лизина и аргинина.

Ч Е Т В Е Р Т И Ч Н А Я С Т Р У К Т У Р А

Если белки состоят из двух и более полипептидных цепей, связанных между собой нековалентными (не пептидными и не дисульфидными) связями, то говорят, что они обладают четвертичной структурой. Такие агрегаты стабилизируются водородными связями, ионными и электростатическими взаимодействиями между остатками аминокислот, находящихся на поверхности глобулы.

Подобные белки называются олигомерами, а их индивидуальные цепи – протомерами (мономерами, субъединицами). Если белки содержат 2 протомера, то они называются димерами, если 4, то тетрамерами и т.д. Например, гемоглобин – белок эритроцитов, переносящий кислород, состоит из 4 гемсодержащих субъединиц – 2 α-субъединицы и 2 β-субъединицы в гемоглобине взрослых, 2 α-субъединицы и 2 γ-субъединицы в фетальном гемоглобине.

Лактатдегидрогеназа – фермент, принимающий активное участие в окислении глюкозы при мышечном сокращении, также включает 4 субъ-

единицы – Н (heart) и М (muscle) в разных сочетаниях: Н4, Н3М1, Н2М2, Н1М3, М4. Всего 5 изоферментов.

Аминокислоты ибелк и

 

 

 

16

 

 

 

 

Креатинкиназа – фермент,участвующийрегенерацииАТФпримышечномсокр

 

 

а-

щенсостоит, субъединиц2з

– В( brain)иМ(

muscle)вразныхсочетаниях:ВВ,ВМ, . М

 

 

Всегоизофермента3 .

 

 

комплемен-

Взаимпродругтомеровсействиедругомосуществляетсяпопринципу

 

тарности,т.е . ихповерхнддругуодитсть

погеометфоипорфункцимеической

 

о-

нальнымгруппамаминокислотвоз(

никновениеионныхводородныхсвязей).

 

 

Таккаксубъединицы

волигомерах очтевзаиньсномодействуютеждусобой,тол

 

ю-

боеизмеконениекакойформации

-либо одной субъединицы обязательновлечетсобой

 

изменениедругихсубъединиц.Этотэффектназывается

 

кооперативноевзаимодействие

.

Например,

у гемоглобина такоевзаимодействсубъединиц

влегких

ускоряет в300раз

при-

соедкислородангемоглобинуние.

Втканях

отдача кислородатакже

ускоряетсяв

300 раз.

Присоединениев

легких первоймолекулыкислорода

коднойизсубъединицгемогл

 

 

о-

биназмееконформняет.Врезультатенацчвлиятьнаюследущуют

 

 

 

 

субъедини-

цу,облегчаяприсоединениекнейкисл.Пэтогослероонив влияютвоеманатретью

тканях перваямолекулакислородаотделясвосубъедтсяй

 

 

 

 

субъединицутакдалее.В

 

 

 

 

 

и-

ницынеочлегко,втораяньужебыстрееитакдал. е

 

 

Т-форма,напряженная(

 

tense),она

Дезоксиформагемобозначаетсяглобинакак

 

англ.

обладаетсущественноболеенизкимсродствкисл. ородум

 

 

 

Оксигенированнаяформа

 

,или

R-форма (англ.

relaxed),обладаетвысосродствккислм. ородум

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Ф И З И К О - Х И МСИВЧОЕЙССКТИВЕА

Б Е Л К О В

 

 

 

 

 

 

 

Ксвойсбелковтамфотернрастворимостьносятвам, ,сп кденатурацииобность,

 

 

 

 

 

коллоидныесвойства.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

А М Ф О Т Е Р Н О С Т Ь

 

 

 

 

Таккакб

елкисодержат

кислыеосновныеамин,тихсоставекиимлотыегда

 

 

 

е-

ютсясвободные

кислыеСОО(

) и основные(

NH3+)группы .

 

 

 

По-

Зарядбелказависитсоотношения

количества кислыхосновныхаминокислот.

 

 

этому,а

налогаминокислотам,чно

белки заряжаютсяположприуменьшениительнорН,

 

 

 

отрицатприегоувеличении. ьно

 

Если рНраствораоответствует

изоэлектрическойточке

 

белка,то заряд белка равен0

.

 

 

 

 

 

Если впептилбелкеиде

 

преобладают кислые аминокислоглутамат( аспартат), ы

 

 

то

при нейтральных рН заряд белка отрицательный и изоэлектрическаяточка

находитсяв

кислой среде.

Длябольшинстваприродныхбелковизоэлектрическаяточканаходитсяв

 

 

 

 

диа-

пазоне рН4,8 -5,4,чтосвидетопрельствуетобладихсоставении

 

глутаминовойаспар

а-

гиновой аминокислот.

 

 

 

 

 

 

 

biokhimija.ru

Тимин О.А. Лекции по общей биохимии (2018г)

17

 

 

 

Если в белке преобладают основные аминокислоты (лизин и аргинин) – при нейтральных рН заряд обусловлен этими, положительно заряженными, аминокислотами.

Амфотерность имеет значение для выполнения белками некоторых функ-

ций, например, их буферные свойства,

т.е. способность поддерживать неизменным рН крови, основаны на способности присоединять ионы Н+ при закислении среды или отдавать их при защелачивании.

С практической стороны наличие амфотерности позволяет разделять белки по заряду (электрофорез) или использовать изменение величины рН раствора для осаждения какого-либо известного белка. Наличие как положительных, так и отрицательных зарядов в белке обусловливает их способность к высаливанию (см "Обратимое осаждение" белков), что удобно для выделения белков в нативной конформации.

Влияние рН на заряд белка

При смещении рН в растворе изменяется концентрация ионов Н+. При закислении среды (при снижении рН) ниже изоэлек-

трической точки ионы Н+ при соединяются к отрицательно заряженным группам глутаминовой и аспарагиновой кислот и нейтрализуют их. Заряд белка становится положительным.

При увеличении рН в растворе выше изоэлектрической точки концентрация ионов Н+ снижается и положительно заряженные группы белка (NH3+-группы лизина и аргинина) теряют протоны, их заряд исчезает. Суммарный заряд белка становится отрицательным.

При физиологических рН буферная емкость белков плазмы крови весьма ограничена, т.к. диапазон смещения рН крови даже при патологии не захватывает изоэлектрические значения рН для глутамата, аспартата, лизина, аргинина. Только гемоглобин, который содержит до 8% гистидина (pI 7,6) обладает существенной буферной емкостью.

Р А С Т В О Р И М О С Т Ь

Так как большинство белков несет много заряженных групп, то в целом они водорастворимы. Растворимость объясняется:

o наличием заряда и взаимоотталкиванием заряженных молекул белка,

o наличием гидратной оболочки – чем больше полярных и/или заряженных аминокислот в белке, тем больше гидратная оболочка (например, 100 г белка альбумина связывает 30-50 г воды).

Аминокислоты ибелк и

18

 

 

 

 

 

М Е ТООСДАБЫЖЕ ДЛ КЕ Н И Я

 

О В

 

 

 

Так как растворимостьбелковзависитот

заряда иналичия гидратнойоболочки

,

то

исчезновениеодногоилиобоэтфакторовихведетосаждениюбелк

 

а.

 

 

 

 

 

ДЕ Н А Т У Р А Ц И Я

 

 

 

Денатурация – необратимоеосаждениебелка

 

из-за разрыва связей,стабилизирующих

 

четверт,третичну,вторичнуюструктуры

 

 

белка, сопровождаемое изменением рас-

творимости,

вязкости,химическактивн,снижениемилиополнойстипотерейбиологич

 

 

 

е-

скойфункции

.

 

 

 

 

 

1.

Физическая денатурация – повышениетемпературы,

 

ультрафиолетовоемикроволн

 

о-

 

воеизлучение,механическиевоздействия,ионизациязаряженнычастица. ми

 

 

 

 

2.

Химическая:

 

 

 

 

 

o

кислотыщелочиобразуютводородныесвязипептидныгруппами

 

,

 

 

o

органическиерастворителиобразуютводородныесвязивызываютдегидрата

 

 

цию,

 

o

алкалоиды образуютсвязиполярнымигруппамиразрываютсистемуводородных

 

 

 

 

 

иионныхсвязей

 

 

 

 

 

o

тяжметаллылые

взаимодействуют с заряжерадикалами,нейтрализуютнымиотр

 

и-

 

цательнзарядые

иразрываютсистемуводородныхионныхсвязей.

 

 

 

 

 

 

 

ОБ Р ОСАЖТ И М ОДЕНИ

Е

 

 

 

Обратимостьосаждениябелковобусловлена

 

сохранением первичной структуры белка.

Восстановление физико-химических биологических свойств белка называется ренативация (ренатурация). Иногда для ренативации достаточно просто удалить денатурирующий объект.

Высаливание

 

 

 

 

 

 

 

Высаливание – это добавлениерастворов

нейтральныхсолей

(Na2SO4, (NH4)2SO4).

Анионы (SO42–) икатионы

(Na+, NH4+) взаимодсзарядамибействуютлка

 

(группы NH4+ и

COO).В

результате зарядисчезает

,исоответств,исчезаетвзаимоотталкиваниемолнно

 

е-

кул.Одновременно

резкоуменьшается

гидратнаяоболочка

.Этоведетк

"слипанию" моле-

кулиосаждению.

 

 

 

 

 

 

 

Таккакбелплазмыкровиотличаютсяпоразмерам,заряду,строению,тоожноп

 

 

 

 

о-

добратьтакиеколичеств

асоли,которыевызовутосаждениеменееустойчивыхбелков,пока

 

 

 

 

другиеещебудутрас. ворены

 

 

 

 

 

 

 

Например,

подобным образом раньше определяли соотношениеальбумины/глобулины

 

вплазмекрови

.Аль,какбуминыолееполярныемолекулы,остаютсяв

 

 

 

растворенномст

о-

яниипр50%насыщраствонейтниисолямир,альнымивтовремякакглобулинывэтих

 

 

 

 

 

услужеовияхсаждаются.В

 

норме соотношение альбумины/глобулины

вплазмекрови

рав-

но1, 2-1,8.

 

 

 

 

 

 

 

 

Осажводоотнимающениеср дствамими

 

 

 

 

 

 

Придобавленииводоотнимающихсредств

 

(ацетон,этано

л) происходит отнятиеу

белка

гидратноболочкий,нонезаряда.

 

Растворимостьнеснижаетсяколько,ноденатурациине

 

 

 

наступает. Наприм,антисдерйствиеэтанолаптическое.

 

 

 

 

 

ИзменениерН

 

 

 

 

 

 

 

МягкоеизменениерН

до изоэлектрическойточк

и белка ведет к исчезновениюзаряда

,

уменьшению гидратнойоболочки

и снижениюрастворимости

молекулы.

 

biokhimija.ru

Тимин О.А. Лекции по общей биохимии (2018г)

19

 

 

 

 

С В О Й С Т В А Б Е Л К О В Ы Х Р А С Т В О Р О В

 

Свойства белковых растворов определяются большими размерами молекул, т.е. белки являются коллоидными частицами и образуют коллоидные растворы. К свойствам коллоидных растворов относятся:

1.Рассеивание луча света, проходящего через белковый раствор, и образование светящегося конуса – эффект Тиндаля.

2.Малая скорость диффузии.

3.Неспособность белковых частиц проникать через полунепроницаемые мембраны (целлофан), т.к. их поры меньше диаметра белков. Это используется в диализе – очистка белковых препаратов от посторонних примесей и лежит в основе работы "искусственной почки" для лечения острой почечной недостаточности.

4.Создание онкотического давления, то есть перемещение воды в сторону более высокой концентрации белка, что проявляется, например, как формирование отеков при повышении проницаемости сосудистой стенки.

5.Высокая вязкость в результате сил сцепления между крупными молекулами, что проявляется, например, при образовании гелей и студней.

КЛ А С С И Ф И К А Ц И Я Б Е Л К О В

П О Ф У Н К Ц И И

См выше "Функции белков"

П О С Т Р О Е Н И Ю

1. По форме молекулы

Глобулярные – соотношение продольной и поперечной осей составляет <10 и в большинстве случаев не более 3-4. Они характеризуются компактной укладкой полипептидных цепей. Например, инсулин, альбумин, глобулины плазмы крови.

Фибриллярные – соотношение осей >10. Они состоят из пучков полипептидных цепей, спиралью навитых друг на друга и связанные между собой поперечными ковалентными и водородными связями. Выполняют защитную и структурную функции. Например, кератин, миозин, коллаген.

2. По количеству белковых цепей в одной молекуле

o мономерные – имеют одну субъединицу (протомер), например, альбумин, миоглобин.

o полимерные – имеют несколько субъединиц. Например, гемоглобин (4 субъединицы), лактатдегидрогеназа (4 субъединицы), креатинкиназа (2 субъединицы),