6 курс / Клинические и лабораторные анализы / Современные_методы_лабораторной_диагностики_инфекционных_заболеваний
.pdf
Ассоциации генотипа по HLA и фенотипа при инфекции
Ген |
Аллели и гаплотипы |
Патоген |
Фенотипическая ассоциация |
|
А*02, A* 0301 |
HBV |
спонтанный клиренс |
|
инфекции |
||
HLA-А |
|
|
|
|
|
спонтанный клиренс |
|
|
A*1101 |
HCV |
|
|
инфекции |
||
|
|
|
|
|
В*08, В*35, 44-Cw 1601, 44-Cw |
HBV |
хроническая инфекция, |
|
0501 |
хронический гепатит |
|
|
|
||
|
B*57 |
HCV |
спонтанный клиренс |
|
инфекции |
||
|
|
|
|
|
B*57, B*14, B*27, Bw-4, B*5701 |
|
долговременное отсутствие |
HLA-В |
|
прогрессирования |
|
|
|
||
|
B*3501 |
HIV |
ускоренное |
|
|
прогрессирование |
|
|
|
|
|
|
B*1801, *3520, В*57, В*5801 |
|
хроническая инфекция |
|
В*46, В*56 |
P. falciparum |
церебральная малярия |
|
Bw53 |
устойчивость к малярии |
|
|
|
||
|
Cw*0102 |
HCV |
спонтанный клиренс |
|
инфекции |
||
|
|
|
|
HLA-C |
Cw4 |
|
ускоренное |
|
HIV |
прогрессирование |
|
|
|
||
|
С*1507 |
|
хроническая инфекция |
Ассоциация полиморфизмов генов цитокинов с инфекциями и их исходом
Ген |
Полиморфизмы и |
Патоген |
Фенотипическая ассоциация |
|
гаплотипы |
||||
|
|
|
||
|
+874A/T |
HBV |
хроническая инфекция |
|
|
СА-повторы |
|||
IFNG |
|
|
||
+874A/T |
M. tuberculosis |
туберкулез |
||
|
–764G/С |
HСV |
спонтанный клиренс |
|
|
–238G/A |
HBV |
хронический гепатит В |
|
|
–857C/T |
|||
|
|
|
||
TNF |
–308G/–238G |
HBV |
хроническая инфекция |
|
|
|
|
||
|
–308G/A |
H. pylori |
гастрит и рак желудка |
|
|
СА-повторы |
HPV18 |
рак шейки матки |
|
|
–1082G/А,–819T/C, –592A/C |
HCV |
хронический гепатит С и цирроз |
|
|
–592 C/A |
|
пневмония, осложненная |
|
IL10 |
+734 G/T |
RSV и другие возбудители |
||
|
||||
|
|
сепсисом |
||
|
+3367 G/A |
|
||
|
|
|
||
|
–592A/C |
M. tuberculosis |
туберкулез |
|
|
–174G/С |
разные возбудители |
хроническое воспаление и |
|
|
|
|||
|
|
|
тяжелый сепсис |
|
|
|
|
сепсис, острый респираторный |
|
IL6 |
–174G/С |
разные возбудители |
дистресс-синдром, |
|
|
|
|||
|
|
|
генерализованное воспаление |
|
|
–236G |
HIV и KSHV |
саркома Капоши |
|
|
+4272C/T |
вирус кори |
корь |
Фармакогенетика в персонализированной медицине
Фармакогенетика
Полиморфизм |
|
|
Скрининг SNP или других |
генов-кандидатов |
|
|
полиморфизмов |
|
|
||
|
|
|
|
Идентификация фармакологических мишеней
Идентификация локусов предрасположенности к болезни
Определение функционального значения полиморфизма
Молекулярная диагностика
Индивидуальная пациентоспецифичная терапия
Инновационная биосенсорная
технология PLEX
Метод основан на сочетании мультиплексной ПЦР с времяпролетной масс-спектрометрии нуклеиновых кислот
Возможности технологии
•SNP-генотипирование
•Количественный анализ экспрессии генов
•Идентификация микроорганизмов (практически все бактерии, вирусы, грибы, определенные виды простейших, в том числе информация о лекарственной устойчивости, вирулентности, токсикогенности)
•Количественный анализ метилирования ДНК
•Профилирование редких соматических мутаций
Апоптоз
Энергозависимый, генетически детерминированный процесс упорядоченной гибели отдельных клеток, который происходит в нормальных и патологически измененных тканях эукариотов под действием внутри- и внеклеточных стимулов.
“Термин “апоптоз” предложен для обозначения до сих пор недостаточно понятного механизма контролируемого разрушения клеток … это активный, по сути программируемый феномен, для которого доказана возможность активации или
подавления |
различными стимулами |
окружающей |
||
среды, |
как |
физиологическими, |
так |
и |
патологическими”.
Kerr J.F.R., Wyllie A.H., Currie A.R. (из статьи “Апоптоз:
фундаментальный биологический феномен, широко участвующий в кинетике тканей”, 1972 г.)
Сравнительная морфология апоптотического и некротического типов гибели клетки (по: Wyllie et al., 1998)
Механизмы программированной гибели клеток
•Внеклеточный (лиганд-рецепторное взаимодействие)
•Внутриклеточный
-митохондриальные рецепторы (белки суперсемейства Bcl-2)
-каспазы
-протеазы
-белки теплового шока
Методология исследования апоптоза
•Маркеры апоптотических процессов отличаются лабильностью, а изменения регуляции апоптоза зачастую предшествуют развитию клинической картины;
•При различных патологических процессах устойчивость клеток к индукции апоптоза, механизмы его развития могут существенно искажаться;
•Применение адекватных методов исследования апоптоза при различных патологических процессах является необходимым условием изучения патогенеза заболеваний;
•В лабораторной практике требуется определение нескольких показателей, а комплекс методов должен быть взаимодополняющим по информативности (феноменологические признаки, состояние молекулярных механизмов инициации и регулирования);
Выделяют две группы исследований
-Морфофункциональные (клеточный и субклеточный уровень)
-Молекулярно-диагностические
(уровни: генетический, рецепторный, регуляторный, эффекторный)