учебники / Osnovy_informatsionnoi_biologii

Основы информационной биологии

Такие системы используют специальный информационно-поисковый язык. Основное назначение информационно-поисковой системы – поиск релевантной информации по запросу пользователя.

Релевантная информация – это информация, имеющая непосредственное отношение к описываемому феномену (объекту, процессу, явлению).

Классификация информационно-поисковых систем: по зоне поиска:

–локальные

–региональные

–глобальные специализированные по назначению:

–поиск документов WWW

–поиск организаций и персон

–поиск файлов.

Информационно-поисковые системы работают с индексной информацией. Индексирование – описание источников информации для использования в специальных базах данных (индексов), используемых информационно-поисковыми системами.

Индексирование (создание описаний) может производиться:

•непосредственно автором(-ами) документов

•автором-составителем тематического каталога

•программой-роботом, автоматически описывающей содержание размещенных в сети документов.

Источники для автоматического создания индексов: - Заголовок документа (Title)

- Подзаголовки разных уровней (используется 6 верхних)

- Аннотация (Description)

- Список ключевых слов (Key words) - Гипертекстовые ссылки - Полный текст документа

Наиболее известные поисковые системы:

-www.google.com

-www.yahoo.com

-www.bing.com

-www.altavista.com

-www.gogo.com

Основы информационной биологии

-www.msn.com

Русскоязычные поисковые системы:

-www.yandex.ru

-www.rambler.ru

-www.aport.ru

-www.google.ru

Специализированные научные поисковые системы осуществляют целенаправленный поиск информации в научных документах. Примеры:

- http://www.scirus.com (с января 2014 г. прекратила функционирование)

-http://scholar.google.com

Первая из перечисленных поисковых систем не осуществляла поиск русскоязычных научных документов, вторая пока имеет в базе незначительное их число.

Метапоисковые системы – компьютерные программы, способные осуществлять поиск с использованием нескольких поисковых систем одновременно: www.search.com и www.excite.com. Метапоисковые системы с кластерным структурированием выводимой по запросу информации в настоящее время приобретают всё большую популярность: www.vivisimo.com

и www.gnome.com.

Русскоязычный интерфейс имеет российская поисковая система www.nigma.ru.

Программы ускоренного поиска – программы, размещаемые на компьютере пользователя и способные осуществлять:

-поиск информации с использованием нескольких поисковых систем одновременно

-сортировку результатов поиска по уровню релевантности

-удаление дубликатов ссылок

•WebFerret

•Search Spides

•Copernic

Прочие специализированные поисковые системы:

-www.public.ru – поиск статей в средствах массовой информации

-http://ditto.com – поиск изображений

Другие функции, осуществляемые с помощью Интернет:

-Организация телеконференций требует применения специализированного программного обеспечения, например, Microsoft Meeting. В наших условиях использование данного сервиса малоэффективно – недостаточно высоки скорости передачи данных.

-On-line перевод текста – текстовой фрагмент или текстовое наполнение WEB-страницы могут быть переведены в режиме on-line,

Основы информационной биологии

www.translate.google.com и www.translate.ru.

-Архивное хранение данных на удаленных серверах – сервис позволяет хранить массивы данных (с ограничением максимального объема) на удаленном сервере. Тем самым обеспечивается резервное хранение или для отдельного компьютера решается проблема недостатка дискового пространства (Google Disk, Yandex Disk либо www.4shared.com, www.hymio.com, www.dropbox.com).

-Получение образования:

•Поиск и получение информации для контрольных и квалификационных работ (курсовые, дипломные работы, диссертации)

•Организация совместных научных проектов

•Поиск информации о научных форумах, стажировках и иных мероприятиях по повышению квалификации

•Дистанционное обучение

1.4 Биоинформационные системы

В широком понимании термина информационная система – это совокупность технического и организационного обеспечения, а также персонала, предназначенная для того, чтобы своевременно обеспечивать целевую группу пользователей релевантной информацией. Информационная система как целостный комплекс методов и средств аккумуляции, функционирует для целенаправленного преобразования и трансляции данных и обеспечения информацией. Основное назначение информационной системы

– хранение и предоставление по запросу затребованной информации. Информационные системы классифицируются в зависимости от степени

автоматизации, сферы и характера их применения (рисунок 1.1).

Основы информационной биологии

Рисунок 1.1 – Классификация информационных систем

Информационные системы в биологии и экологии могут быть классифицированы по характеру аккумулируемой и обрабатываемой информации:

знания о биологических объектах, процессах, явлениях и

системах;

информация об объектах, заключающих знания о биологических объектах, процессах, явлениях и системах.

Основы информационной биологии

ТЕМА 2: НАУЧНО-ИНФОРМАЦИОННАЯ ДЕЯТЕЛЬНОСТЬ В БИОЛОГИИ

ПЛАН:

2.1Теория научной информации, ее предметная область

2.2Документы как носители научной информации и их аналитикосинтетическая переработка

2.3Типология научно-технической информации

2.1 Теория научной информации, ее предметная область

Современный период развития общества характеризуется переходом от индустриальной к информационной цивилизации. Построение информационного общества становится приоритетной задачей. В новом обществе требуется новый тип образования - «опережающий». Специалистом сегодня становится лишь тот, кто постоянно усваивает новые знания, объем которых удваивается каждые полтора года. Возрастает необходимость получения новой информации, обновления знаний, повышения квалификации, освоения новых видов деятельности.

Существующий рынок информационных услуг в соответствии со своей структурой требует от пользователя определенной суммы знаний, навыков, умений. Пользователь должен знать свои информационные потребности, уметь их трансформировать в запросы на информационном языке, который присущ данной структуре, иметь навыки пользователя в системе коммуникаций рынка информационных услуг. Человек информационно грамотный – это тот, который осознает потребность в информации, умеет ее

осведомление) – это содержание какого-либо сообщения, сведения о чем-либо, рассматриваемые в аспекте их передачи в пространстве и времени; значение данных, фактов. В Федеральном законе Российской Федерации от 27 июля 2006 г. №149-ФЗ «Об информации, информационных технологиях и о защите

актуальной, которая возможна лишь при наличии субъекта, некоторой третьей стороны, способной ее уловить, извлечь, оценить и использовать, –

социальной.

Социальная информация представляет собой отражение выявленных человеком в своей жизнедеятельности различий в качественном состоянии объектов, их связей и взаимоотношений. Познавая природную информацию,

Основы информационной биологии

человек переводит ее в социальную, но как мыслящее существо и сам производит последнюю.

Таким образом, информацию, передающуюся в человеческом обществе и активно участвующую в формировании общественного сознания, называют социальной. Социальной информации присущи свойства, отличающие ее от других материальных объектов. Они делятся на атрибутивные и ценностные. Атрибутивные свойства объективны, т. е. не зависят от человека, его воли и желаний. К ним относятся:

неотделимость материального носителя и языковой природы информации;

дискретность – свойство передаваться, храниться и использоваться

по частям;

избыточность информации – свойство многократно дублироваться

вструктуре материальных носителей, гарантирующее устойчивость и надежность ее передачи;

рассеяние – свойство, способствующее хаотичному, неконтролируемому распространению информации во времени и пространстве, вследствие чего затрудняется ее использование. Данное свойство отражает стремление информации расширять сферу своего влияния;

концентрация – сужение поля возможного распространения информации, ограничение ее распространения различными рамками. Одновременно оно характеризует способность путем отражения в структуре материальных носителей накапливаться, сохраняться во времени.

Информация, кроме перечисленных выше атрибутивных свойств, обладает также рядом свойств, характеризующих степень ее полезности для потребителя. Эти свойства носят относительный характер.

Качественные характеристики:

достоверность (приближенность информации к источнику или точность ее передачи);

объективность (информация, очищенная от неизбежных искажений, возникающих при ее передаче, например, по неформальным каналам);

своевременность;

релевантность (степень соответствия информации решаемой

задаче);

актуальность (важность информации в конкретный момент

времени).

Количественные характеристики:

полнота (информация без «информационного шума»);

достаточность (количество информации, достаточное для принятия определенного решения).

Основы информационной биологии

Ценностные характеристики:

ценность (ценностная информация для решения конкретной

задачи);

стоимость (все расходы по факту получения информации). Уровень полезности социальной информации определяется степенью ее

воздействия на воспринимающего субъекта. Если индивид, получивший информацию, приобрел необходимые ему знания, выработал правильное поведение, испытал эмоциональное удовлетворение и т. д., то информацию следует считать полезной.

Доминирующий признак социальной информации – ее общественное назначение, согласно которому выделяют информацию массовую, групповую и межличностную.

Массовая информация – это разновидность социальной информации, предназначенной для всех и использующейся всем населением. Она собирается, накапливается, обрабатывается и передается по официальным каналам с помощью средств массовой информации. Между создателем информации и ее потребителем – социальный заказ.

Групповая информация отражает более глубокое представление о различных сторонах материального мира, общества и человеческого мышления. Специфическая особенность групповой информации – однородность потребителей и ориентация на целевые социальные группы. В свою очередь, групповая информация дифференцируется по областям знания (математика, астрономия, физика, медицина и т. д.) и отраслям производственной деятельности (строительство, транспорт, машиностроение и т. д.). Реализуется групповая информация в таких видах документов, как научные и производственные издания, переписка учреждений и организаций, научно-технические отчеты, депонированные рукописи и т. д.

Межличностная информация адресуется кругу лиц, связанных родственными, дружескими, профессиональными и другими отношениями. При документировании этот вид информации фиксируется в письмах, фотографиях, зарисовках. Особенностью этих документов является четкая направленность адресату.

техническую. Особенно важную роль играет научная информация. Научная информация – это получаемая в процессе познания логическая информация, адекватно отражающая явления и законы природы, общества и мышления и используемая в общественно-исторической практике. Адекватность отображения научной информацией реального мира означает, что она должна обладать способностью повышать уровень человеческих знаний. Создать истинно научную информацию индивид способен только в том случае, если он овладел современным уровнем знаний.

Основы информационной биологии

Техническая информация создается в процессе исследований и разработок в области механизации и автоматизации трудовой деятельности, производственная возникает в сфере производства, сбыта и использования промышленной и сельскохозяйственной продукции.

Известно, что одним из законов общественного развития является взаимосвязь науки, техники и производства. Более того, наука стала

практике информационного обслуживания пользуются понятием «научнотехническая информация», которая имеет отношение к науке, технике и производству. Научная и техническая информация занимает особое место в жизнедеятельности общества, поскольку направлена на поддержание всех ее сфер: науки, образования, производства, экономики и социальной сферы. Это своего рода элемент, обеспечивающий взаимодействие разных сфер жизнедеятельности

Таким образом, исходя из вышесказанного, можно сделать вывод, что информация – это сведения или данные, объективно отражающие различные стороны и элементы окружающего мира и деятельности человека на определенном этапе развития общества, представляющие для него какойлибо интерес и материализованные в форме, удобной для использования, передачи, хранения и обработки человеком или автоматизированными средствами.

2.2 Документы как носители научной информации и их аналитикосинтетическая переработка

Документы являются материальными носителями научной информации. Документ – это объект, содержащий на любом материальном носителе информацию, предназначенную для хранения и распространения в пространстве и во времени (от documentum – свидетельство, письменное подтверждение правовых отношений и/или событий). В широком смысле документ служит средством закрепления и передачи информации, знаний, духовных и материальных достижений человеческого общества. Документ является результатом и предметом духовной и материальной культуры. Документы могут содержать текстовую, цифровую, графическую и аудио информацию, они могут подвергаться процессам записи, поиска, передачи, получения, сбора и чтения.

Известно, что анализ и синтез являются главными методами мышления. Анализ (греч. analysis – разложение, расчленение) и синтез (греч. synthesis – соединение, сочетание, составление) – это процессы мысленного расчленения целого на составные части и воссоединения целого из частей.

Аналитико-синтетическая переработка (АСП) информации имеет место в

Основы информационной биологии

научно-информационной деятельности (НИД), а также в других видах познания.

Целью научно-исследовательской деятельности и АСП информации в ее ходе является извлечение из документов новых фактов или сведений, которые в этих документах в явном виде не выражены. Новые сведения логически выводятся из имеющейся информации, причем для этого дополнительно привлекается так называемая экстралингвистическая информация (т.е.

информация, не содержащаяся в этих документах). Таким образом, из текста путем логического анализа содержащейся в нем информации получают сведения, не содержащиеся в нем в явном виде.

Специфика АСП информации при НИД заключается в группировке, сопоставлении, оценке и обобщении той и только той информации, которая явно имеется в этих документах, а также в представлении обобщенной информации в компактном виде, удобном для ее практического использования.

Аналитико-синтетическая переработка (АСП) документов состоит в представлении каждого отдельного документа или их определенной совокупности в таком виде, который максимально отвечает той или иной задаче научно-информационной деятельности. Потребность в анализе и синтезе научной информации, возникла вследствие ускоренного развития науки и техники, а именно:

- Количество появляющихся научных документов стало настолько большим, что ученый или специалист не имеет времени читать или просматривать все соответствующие его интересам источники;

-Возникла острая необходимость не только в сведениях о научной информации, но и в самой научной информации, т.е. в конкретных фактических данных или в так называемой фактографической информации. Такая информация должна быть предварительно подвергнута критической оценке и обработана с учетом ее назначения и использования;

-В научно-технической литературе публикуется очень много научной информации, которая является ненадежной, устаревшей или даже неправильной. К тому же научная информация обычно бывает рассеяна по разным документам, опубликованным или подготовленным в разное время, на нескольких языках и в разнообразной форме. Поэтому возникла необходимость не только в сборе, систематизации и физической «конденсации» такой информации, но и в ее критической оценке и обобщении.

Основными видами АСП документов являются:

•библиографическое описание;

•их классификация (индексирование);

•аннотирование;

•реферирование;

Основы информационной биологии

•перевод с одного языка на другой;

•составление обзоров

Каждому виду такой переработки свойственно определенное соотношение анализа и синтеза. Никакого синтеза не производится при научном переводе, в то время как при подготовке обзоров удельный вес синтетической работы достигает своего максимума. В процессе создания вторичного документа производится свертывание информации, которое состоит в уменьшении ее физического объема, изменении знаковой формы (при индексировании), оценке новизны, научной, практической и другой ценности документа.

Документальные источники содержат в себе основной объем сведений, используемых в научной, преподавательской и практической деятельности, и поэтому в этом разделе речь идет именно о них. К документам относят различного рода издания, являющиеся основным источником научной информации. Издание – это документ, предназначенный для распространения содержащейся в нем информации, прошедший редакционно-издательскую обработку, полученный печатанием или тиснением, полиграфически самостоятельно оформленный, имеющий выходные сведения.

Таким образом, по характеру обработки содержащихся в них данных, документы принято разделять на первичные и вторичные.

Первичный документ – любой материальный носитель, непосредственно фиксирующий любой результат познания реального мира или духовной, творческой и информационной деятельности (в виде описания фактов, отношений между ними, выявленных закономерностей, концепций, гипотез и т. д.). Документ, содержащий оригинальное произведение, свод произведений, материалы и результаты исследований и разработок: первичную статистику, фактографическую и нормативно-правовую информацию; учебные, инструктивно-методические, практические материалы и пособия, а также литературно-художественные, изобразительные, музыкальные и аудиовизуальные произведения. Все разнообразие первичных опубликованных документов зафиксировано в ГОСТе 7.60–2003 СИБИД. Издания. Основные виды. Термины и определения.

К вторичным относятся документы, являющиеся результатом аналитико-синтетической, логической переработки одного или нескольких первичных документов. В их числе: библиографические пособия, реферативные сборники, обзоры, рецензии. Вторичные документы выполняют две основные функции:

оперативно оповещают о появлении первичных документов;

в сжатом виде излагают основное их содержание.

Считается, что в первичных документах отражаются непосредственные результаты познания, а во вторичных – результаты аналитико-синтетической переработки информации, содержащейся в первичных документах. Однако