- •Постгеномные технологии
- •Протеомика
- •3. Инвентаризация белка
- •4. Фолдинг белка
- •Фолдинг белка. Шапероны.
- •Правильный фолдинг белков защитит нейроны
- •5. Протеомика и заболевания
- •6. Метаболомика
- •История возникновения
- •Метаболом
- •Метаболиты
- •Метабономика
- •Основные приложения
- •Экспериментальные методы системной биологии
- •7. Метаболитическое профилирование Метаболическое профилирование и фингерпринтинг
СЕМИНАР №3. 05.10.2011 г.
1) постгеномные технологии 2) протеомика 3) инвентаризация белка 4) фолдинг белка 5) протеомика и заболевания 6) метаболомика 7) метаболитическое профилирование
-
Постгеномные технологии
Постгеномные технологии - это технологии, которые возникли на основе наших знаний о геномах живых систем и, в первую очередь, генома человека. Они не пришли на смену существовавшим геномным технологиям, а являются их дальнейшим развитием Основные задачи постгеномных технологий. 1. Генотипирование 2000 человек по 400 000 snp за 10 000$ или меньше. 2. Возможность секвенировать ДНК со стоимостью на 4-5 порядков ниже, чем в настоящее время, т.е. человеческий геном должен стоить не более 1000$. 3. Необходимо создать технологии, позволяющие синтезировать длинные молекулы ДНК по цене не более 10 центов за основание. Стоимость синтеза одного гена должна быть не выше 10 000 $. 4. Необходимо создать методы определения метилирования всей ДНК в одной клетке. 5. Необходимы технологии, обеспечивающие одномоментный мониторинг всех белков в одной клетке |
Постгеномные технологии - это технологии, которые возникли на основе знаний о геномах живых организмов. Сюда входят такие современные направления исследований, как транскриптомика, протеомика, метаболомика и интерактомика. Результатом постгеномных исследований является накопление обширной и разнообразной информации, которая обрабатывается методами биоинформатики и постепенно трансформируется в системную биологию.
С 1994 года в группе идет активная работа по разработке комплексного экспериментально- биоинформатического подхода к исследованию убиквитин-зависимых механизмов клеточной регуляции.
В состав паспорта Критической технологии «Геномные, протеомные и постгеномные технологии» вошли направления, связанные с разработкой лекарств — продуктов химического и пептидного синтеза, генно-терапевтические средства, а также исследовательские и медицинские технологии для многопараметрической молекулярной диагностики, в том числе, необходимые для работы в диапазоне ультранизких концентраций.
Геномные и постгеномные технологии отражают новые принципы анализа живых систем на молекулярном уровне, отличающиеся высокой производительностью. В составе КТ отражены три основные тенденции развития этих технологий:
-
геномные технологии, базирующиеся на полимеразной цепной реакции, позволяющей размножать анализируемые молекулы до уровня чувствительности измерительных приборов;
-
протеомные технологии как представитель группы технологий, для которых аналог полимеразной цепной реакции отсутствует, что определяет необходимость увеличения чувствительности до уровня детектирования единичных молекул;
-
применение технологий биоинформатики в качестве интегрирующего начала для обобщения постгеномных данных в рамках моделей сравнительной геномики и системной биологии.
Описание Критической технологии
Критическая технология обеспечивает решение задач молекулярной медицины, промышленной биотехнологии и сельского хозяйства за счет расшифровки генетической информации на всех уровнях ее реализации. К таким уровням относятся, помимо собственно генома, совокупность всех РНК клетки (транскриптом), эпигенетических состояний ДНК клетки (эпигеном), белков (протеом) и белковых комплексов (интерактом), набор эндогенных метаболитов (метаболом), совокупность геномов экосистем (метагеном).