- •АМИНОКИСЛОТЫ
- •АМИНОКИСЛОТЫ
- •КЛАССИФИКАЦИЯ
- •В зависимости от количества функциональных гр. различают:
- •Общая формула алифатических насыщенных моноаминокислот:
- •Алифатические АК в зависимости от взаимного расположения –СООН и –NH2 – групп делятся
- •Природные -АК делятся на
- •В зависимости от строения углеводородного R -АК делятся на алифатические,
- •Номенклатура
- •CH3 CH CH COOH
- •Для АК характерна структурная изомерия, обусловленная как строением С-скелета, так и расположением функциональных
- •АК, подобно МС, относят к D- и L-
- ••Большинство природных АК, участвующих в биохимических процессах содержат первичную аминогруппу, находящуюся в
- •Важнейшие -АК
- •(CH3)2CH CH COOH Валин*
- •HOOC
- •СПОСОБЫ ПОЛУЧЕНИЯ АК
- •Способы получения:-АК
- •• 2). Аминирование эфиров-галогензамещенных к-т (синтез Габриэля)
- •3). Циангидринный синтез (синтез Шреккера- Зелинского)
- •• 1)-2) способы синтеза с
- •Разделение рацемической смеси
- •Получение -АК
- ••2) Синтез Родионова с малоновым эфиром
- ••Для синтеза , - и т. д. АК могут быть
- ••Ароматические АК получают восстановлением соответствующих нитросоединений.
- •ФИЗИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА
- ••В состав молекулы АК входит аминогруппа, обладающая основными свойствами и карбоксильная группа, обладающая
- •акцептор
- •-АК в твердом виде находятся в
- •• Значение рН, при котором
- •В случае моноаминокарбоновых кислот водные р-ры в большинстве случаев имеют слабокислую реакцию (pH
- •ХИМИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА
- ••2) Образование сложных эфиров реакцией этерификации
- •3) Получение ангидридов АК. Получение ангидридов АК сопряжено с трудностями, т. к. требуют
- •• 4) Декарбоксилирование
- ••Реакции по NH2-группе
- •2)Образование алкилпроизводных
- ••Моноалкилирование хорошо протекает при бензилировании:
- ••3) Арилирование
- ••4) Образование ацилпроизводных.
- ••Реакция ацилирования имеет большое значение при синтезе пептидов для защиты аминогруппы.
- •• А) Карбобензоксизащита
- ••Б) БОК-защита – в качестве защиты используется трет- бутоксикарбонильная гр.
- •CF3COOH снятие защиты
- •5) Реакция с азотистой кислотой (дезаминирование)
- •Реакции с участием NH2- и
- •2) Окислительное дезаминирование
- •3) Отношение к нагреванию
- •Качественные реакции на АК
- ••2) Ксантопротеиновая р-ция
- •Нитросоединения тирозина и триптофана в отличие от нитропроизводного фенилаланина в щелочной среде образуют
- ••3) Реакция Фоля
- •HS H2C CH COO_ 2NaOH
- •Пептидный синтез
- •Пептидный синтез представляет весьма сложную, тонкую экспериментальную задачу. Прямой конденсацией -АК пептиды
- •Для синтеза пептидов заданнного
- •3)Проводят конденсацию полученных производных
- •Синтез дипептида Gly-Ala:
- •Защита СООН-гр. С-концевой АК
- •Образование пептидной связи
- •ПЕПТИДЫ, БЕЛКИ
- •• Провести четкую грань между
- •Классификация
- •5)токсические белки;
- ••По хим. строению и степени сложности белки подразделяют на группы:
- ••Простые белки в свою очередь делятся на основании некоторых условно выбранных критериев на
- •Классификация сложных белков основана на хим. природе входящей в их состав простетической группы.
- ••Многие белки имеют тривиальные названия, присвоенные чаще всего в зависимости либо от источника
- •В соответствии с номенклатурой IUPAC в наименовании пептидов используются тривиальные названия всех аминокислот,
- •СТРОЕНИЕ
- •Полиамиды длиной от 2 до нескольких десятков АК остатков часто называют пептидами, при
- ••Несмотря на разнообразие, элементный состав белков колеблется незначительно.
- ••ММ белков колеблется в широких пределах от нескольких тысяч до миллионов. Так. миоглобин
- ••При образовании белка в результате
- ••Полипептидная цепь пептидов и белков имеет неразветвленное строение и состоит из чередующихся амидных
- •амидные группы
- ••Названия пептидов строят путем последовательного перечисления АК-ых остатков, начиная с N-конца. Т.к. эти
- ••Высокомолекулярные полипептиды и белки обладают весьма сложным строением и характеризуются четырьмя уровнями структуры
- •Состав белковой молекулы, представленный в виде чередующихся остатков аминокислот, называют
- •Для определения аминокислотного состава пептид подвергают ферментативному или кислотному гидролизу. Полученный гидролизат анализируют
- •Выяснение порядка расположения АК в полипептидной цепочке осуществляют с помощью метода секвенирования .
- ••Определение АК-ой последовательности
- •Метод Эдмана
- •• Метод Сэнгера
- •• Дансильный метод
- ••Дансильный метод наиболее предпочтительный, т.к.
- •В настоящее время созданы специальные автоматизированные установки для проведения всех перечисленных операций -
- ••Методы определения последовательности АК-ого состава на С-конце менее совершенны. Для последовательного отщепления
- •Кроме последовательности АК полипептида (первичной структуры), крайне важна трехмерная структура белка, которая формируется
- •Атомы С, O, N в пептидной гр.
- ••Вследствие М-эффекта на О-атоме возникает --заряд (он становится более ЭД), а на N-атоме
- •-С-атомы АК остатков в полипептидной
- ••Вторичная структура описывает пространственное строение одной полипептидной цепи. Наиболее распространённые типы вторичной структуры
- ••Основное значение в закреплении этой пространственной структуры имеют Н-связи, которые направлены практически параллельно
- ••β-листы (складчатые слои) –
- •к С-концу
- ••Многие белки одновременно содержат структуры-спирали и складчатого листа с преобладающим
- •• Третичная структура –
- ••– ковалентные связи (между двумя остатками цистеина –
- ••– ионные связи между противоположно заряженными боковыми группами АК остатков
- •– Н-связи между функц. гр. боковых радикалов, а также между ними и пептидынми
- ••– гидрофильно-гидрофобные взаимодействия. При взаимодействии с окружающими молекулами воды белковая молекула «стремится» свернуться
- ••По типу упаковки различают
- ••Четвертичная структура –
- •Напр. у гемоглобина полипептидная цепь (перв. структура) закручена в
- •Пространственная структура белков способна нарушаться под влиянием разл. физ.и хим. факторов: т-ры, облучения,
- •Свойства
- •Химические свойства
- •2). Нингидриновая реакция – появление синей окраски при взаимодействии с нингидрином (0,5% р-р).
- •3). Ксантопротеиновая р-ция – появление желтой окраски в результате действия на белки конц.
- •Гидролиз
- •Схема гидролиза
•Полипептидная цепь пептидов и белков имеет неразветвленное строение и состоит из чередующихся амидных и метиновых групп. Конец цепи, на к-
ром находится АК со свободной NH2- группой, называется N-концом; второй конец, на к-ром находится АК со свободной СООН-гр. – С-концом.
амидные группы
метиновые группы |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
метиновые группы СН |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
O |
|||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||
|
|
|
|
|
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||
H2N |
|
CH |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
HN |
|
|
CH |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
...HN |
|
|
|
CH |
|
C |
|
OH |
||||||||||
|
|
|
C |
HN |
|
|
CH |
C |
|
|
|
|
C |
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Rn' |
|
|
|||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
R'' |
|||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
R' |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||
|
|
R |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
C- |
|
конец |
|||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||
N-конец |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||
|
боковые радикалы |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
•Названия пептидов строят путем последовательного перечисления АК-ых остатков, начиная с N-конца. Т.к. эти остатки находятся в молекуле пептида в виде ацила, то им дается суффикс «ил». Название С-концевой АК со свободной СООН остается без изменения.
|
|
|
|
|
|
|
трипептид |
||||||||||||||||||||
N-конец O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
C-конец |
||||||||||||
|
|
|
|
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
O |
|||||||||||||
H2N |
|
CH |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
C HN |
|
|
CH |
|
C |
|
HN |
|
|
CH |
|
C |
|
OH |
|||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||||
|
2 |
||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
CH3 |
|
|
|
|
|
CH2SH |
|||||||||||
|
|
|
|
глицил |
аланил |
цистеин |
|
Gly-Ala-Cys
Thr - Leu - Tyr
CH |
|
|
CH |
CH |
|
|
|
|
|
COOH |
|
|
|
|
|
|
|
(CH3)2CH |
|
|
CH2 |
|
CH |
|
COOH |
||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
3 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Leu (лейцин) |
|
|
|
|
||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
NH2 |
|||||||||||||||||||||
OH |
NH2 Thr (треонин) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
HO |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
CH |
|
|
|
CH |
|
|
COOH |
|
|
|
|
||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
2 |
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
NH2 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Tyr(тирозин) |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||
|
|
|
N-конец |
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
O |
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||
|
|
|
H2N |
|
|
|
CH |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
C |
HN |
|
|
CH |
|
C |
|
HN |
|
|
CH |
|
C |
|
OH |
|||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
2 |
|
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
HO |
|
СH |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
CH2 C-конец |
||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
CH2 |
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
CH3 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
CH(CH3)2 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
треониллейцилтирозин |
OH |
|
•Высокомолекулярные полипептиды и белки обладают весьма сложным строением и характеризуются четырьмя уровнями структуры –
•первичной,
•вторичной,
•третичной
•и четвертичной
Состав белковой молекулы, представленный в виде чередующихся остатков аминокислот, называют
первичной структурой белка.
Первичная структура полипептидной молекулы определяется двумя важными характеристиками – АК составом и АК последовательностью.
Аминокислотный состав пептидов и белков – это природа и количественное соотношение входящих в них -АК.
Для определения аминокислотного состава пептид подвергают ферментативному или кислотному гидролизу. Полученный гидролизат анализируют (в настоящее время используют аминокислотные анализаторы).
Аминокислотная последовательность это порядок чередования
-аминокислотных остатков.
Выяснение порядка расположения АК в полипептидной цепочке осуществляют с помощью метода секвенирования . Секвенирование позволяет определить АК последовательность в полипептидах, размер которых не превышает несколько десятков АК остатков, поэтому необходимо предварительное разрезание исходного полипептида на короткие фрагменты.
Для специфического расщепления белков по определенным точкам применяются как ферментативные, так и хим. методы.
Из ферментов наиболее широко используют трипсин и химотрипсин.