Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:
книги / Нелинейная физика ДНК..pdf
Скачиваний:
1
Добавлен:
12.11.2023
Размер:
16.39 Mб
Скачать

Предметный указатель

Акустическая

ветвь 79, 81, 85, 87, 126

волна 80, 181

мода 56

скорость 80, 197

Асимметрия структуры ДНК 144, 151, 169

Базы данных в Интернете 35 Белок-нуклеиновое взаимодейст­

вие (белок-нуклеиновое узнава­ ние) 29, 62, 66

Бозе газ 91, 98, 104 Бозе оператор 91, 97 Бризер 113, 138, 142, 213

Взаимодействия

водородные 17, 19-22, 29, 34, 41, 42, 137-143, 166, 167, 173-175, 184, 211

ковалентные 21, 22, 44, 62

на дальних расстояниях 19

стэкинговые 19, 21, 22, 50 Внутренние движения ДНК

В —►А переход 47, 48

В —►Z переход 47-49, 87

движения оснований

-----изменение наклона 43, 44

-----качение 43, 44

-----поднятие 43, 219

-----пропеллер 42, 44

-----раскрытие 42, 49, 59, 60, 111, 137, 193, 194

-----расположение вшахматном порядке 42, 43

-----растяжение 42, 43, 141

-----сдвиг 42

-----скольжение 43

----- смещение 43,

137, 140, 144,

148,

167,

169,

179, 211,

212

движения сахарофосфатного остова 44

изгиб ДНК 28, 39, 75, 215

изгибные движения 39, 109

локальное разделение нитей 49,

212

твист 215

торсионные движения 39, 214 Внутренняя подвижность 36

—* классификация 37, 38 Водородно-тритиевый (-дейтерие­

вый) обмен 5, 50, 193

Генная

транскрипция 64, 67-69, 207-

210

трансляция 67, 69

экспрессия 67, 72

Граница 63, 160-164, 204, 205

Динамика ДНК 36, 50, 54

Задача рассеяния 56, 99, 100, 102, 103, 109, 178, 197

Иерархия

динамических моделей ДНК 51,

структурных моделей ДНК 29 Интеркаляция 65 Инфракрасная спектроскопия 35,

54, 58 Инфракрасное рассеяние 109, 181

Кинк ИЗ, 114, 131, 136, 142, 147,

150,

159,

168,

175,

179,

194,

204,

205, 208, 210

 

 

 

 

 

Корреляционные

функции

91,

97,

102,

104,

105,

177,

185,

 

188

 

Линейная теория 74, 108

Метод Ньютона 127 Метод Херемана 131

Микроволновое поглощение 60, 109, 159, 195

Модель

Y 121-123, 126, 167-169, 171, 184, 206

Барби 141, 142

более высоких уровней иерар­ хии 85, 143

Волкова 86, 147, 204

Ичикавы 117

Кампа 142

Крумхансла и Алекзандер 86, 145

Муто 115, 138-140, 159, 196

Пейарда и Бишопа 137, 172, 206,

211

синус-Гордона 112, 179, 182

структуры ДНК 27-29

— Христиансена 116

Нейтронное рассеяние

«замороженной» ДНК 100

неупругое рассеяние 54, 55, 57, 103, 179-181, 183, 185, 191, 198

упругое рассеяние 102, 109 Нелинейная модель

двойного стержня 138

денатурации ДНК 138, 172-174, 211-213

упругого стержня 53, 74, 75, 99,

114-116, 120, 126 Нелинейная теория ДНК ПО, 151,

172 Нелинейное математическое моде­

лирование ПО Нелинейные модели более высого

уровня иерархии 143 Нелинейный механизм

конформционных переходов 144, 147-149, 203-205

регуляции транскрипции 207,

209 Неоднородность 63, 64, 160

Низкочастотный спектр 54, 59, 109

Организация ДНК в клетке 26

Параметры однородной динамиче­ ской модели ДНК 217, 219

Перенос заряда 61, 62 Подход Бишопа и Пейарда 172 Полиморфизм 35

Представление вторичного кванто­ вания 90, 96

Рамановское рассеяние 54, 109 Регуляция генной экспрессии 70 Регуляция транскрипции 207

Рентгеноструктурный анализ 34

— синус-Гордона 112, 113, 152, 156,

Репликация

72,

73

166,

168,

175,

176,

194, 209

 

 

 

----- двойного 168

 

Силовые константы для

Флуоресцентная

деполяризация

— изгибных движений 219

— изменения наклона 219

108, 202

 

 

 

— качения 218

 

Фононы в

 

 

 

— поднятия 219

— модели двойного стержня 92

— растяжения

водородных связей

— модели упругого стержня 88

219

 

 

— моделях более высокого уровня

— торсионных движений 215

98

 

 

 

 

Силы, действующие на дальние

Функция ДНК 63, 64, 66, 69, 72,

расстояния 22

203

 

 

 

 

Скорость

 

 

 

 

 

 

 

— звуковых волн 56, 109, 218

Частоты

 

 

 

— изгибных волн 81

— изгибных колебаний 81, 85

— продольных волн 80

— поперечных колебаний 84

— солитона 113, 156-158, 163, 164,

— продольных колебаний 79, 84,

176

 

 

85

 

 

 

 

— торсионных волн 197

— торсионных колебаний 79, 84,

Солитон 108, 156-159, 164-166,

85,

125, 126, 220

 

172, 175-178, 180, 188, 195, 197,

 

 

 

 

 

204, 205, 207, 208, 210, 211

Экспериментальные исследования

Спиральная модель синус-Гордона

— динамики ДНК 54

 

182, 199

 

 

— одиночной молекулы ДНК 62

Статистика

 

 

— структуры ДНК 34

— линейных возбуждений 88

Электростатический потенциал 23

— нелинейных возбуждений 172

Эффекты

 

 

 

Структура ДНК

— асимметрии 169

 

— вторичная 18

— влияния среды 151

 

— первичная 15

— дальнодействия 70, 71, 203, 205,

— третичная 25

206

 

 

 

 

Суперспиральная ДНК 25, 26, 29,

— диссипации 151, 152, 157, 196

39, 202

 

 

— неоднородности 63, 64,151,160—

Термостат (тепловая баня) 36, 159

162,

164,

165

 

 

— спиральности 167

 

Уравнение

 

 

ЯМР 35, 50, 54, 60, 61, 109

Якушевич Людмила Владимировна

Нелинейная физика ДНК

Дизайнер М. В. Ботя Технический редактор А. В. Широбоков

Компьютерный набор и верстка Д. В. Панкратов Корректор Г. Г Тетерина

Подписано в печать 21.12.2007. Формат 60 х 84У16. Печать офсетная. Уел. печ. л. 14,65. Уч. изд.л. 14,21. Гарнитура Антиква. Бумага офсетная №1. Заказ №67.

АНО «Ижевский институт компьютерных исследований» 426034, г. Ижевск, ул. Университетская, 1.

http://shop.rcd.ru E-mail: mail@rcd.ru Тел./факс: (+73412) 500-295