- •Тема 1. Предмет, задачи, основные этапы и современные направления развития биохимии. Цель и методы проведения биохимических исследований, их клинико-диагностическое значение.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 2. Исследование строения и физико-химических свойств белков-ферментов.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Изучить физико-химические свойства белков-ферментов.
- •Тема 3. Определение активности ферментов. Единицы измерения каталитической активности ферментов. Исследование ферментативных процессов по типу реакций основных классов ферментов.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 4. Исследование механизма действия ферментов и кинетики ферментативного катализа.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 5. Исследование регуляции ферментативных процессов.
- •Алгоритм лабораторной работы.
- •Тема 6. Медицинская энзимология.
- •Изменение активности ферментов в тканях может служить критерием биохимической диагностики, а изучение динамики этих изменений указывает на эффективность лечения.
- •Чистые ферменты и их смеси широко используются как лекарственные препараты в терапии, хирургии, офтальмологии и других областях медицины.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 7. Исследование роли кофакторов и коферментных витаминов в каталитической активности ферментов.
- •Тема 8. Исследование роли кофакторов и коферментных витаминов в каталитической активности ферментов.
- •Актуальность темы.
- •Тема 9. Фундаментальные закономерности обмена веществ. Общие пути превращений белков, углеводов, липидов.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 10. Исследование функционирования цикла трикарбоновых кислот.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 11. Биоэнергетические процессы: биологическое окисление, окислительное фосфорилирование.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 12. Хемиосмотическая теория окислительного фосфорилирования. Ингибиторы и разобщители окислительного фосфорилирования.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 13. Исследование гликолиза – анаэробного окисления глюкозы.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 14. Исследование аеробного окисления глюкозы.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 15. Альтернативные пути обмена моносахаридов. Метаболизм фруктозы и галактозы.
- •Тема 16. Исследование катаболизма и биосинтеза гликогена. Регуляция обмена гликогена.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 17. Глюконеогенез.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 18. Исследование механизмов метаболической и гормональной регуляции обмена углеводов.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 19. Исследование катаболизма и биосинтеза триацилглицеролов. Установление молекулярных механизмов регуляции липолиза.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 20. Транспортные формы липидов.
- •Актуальность темы.
- •Количественное определение β- и пре-β-липопротеидов имеет большое значение для диагностики атеросклероза, ишемической болезни сердца (ИБС), ожирения, хронических заболеваниях печени, так как позволяет выявить повреждение паренхимы печени.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 21. Бэта-окисление жирных кислот. Исследование обмена жирных кислот и кетоновых тел.
- •Тема 22. Биосинтез жирных кислот. Обмен сложных липидов.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 23. Биосинтез и биотрансформация холестерола. Исследование нарушений липидного обмена: стеаторея, атеросклероз, ожирение.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 24. Исследование превращений аминокислот (трансаминирование, дезаминирование, декарбоксилирование).
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 25. Биосинтез глутатиона и креатина.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 26. Исследование процессов детоксикации аммиака и биосинтеза мочевины.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 27. Биосинтез порфиринов. Наследственные нарушения обмена порфиринов.
- •БИОХИМИЯ ТКАНЕЙ И ФИЗИОЛОГИЧЕСКИХ ФУНКЦИЙ
- •Тема 1. Строение и функции нуклеиновых кислот.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 2. Исследование биосинтеза и катаболизма пуриновых и пиримидиновых нуклеотидов. Определение конечных продуктов их обмена.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Знать биохимическую динамику превращения нуклеотидов, основы их патохимии и биохимической диагностики.
- •Индивидуальная самостоятельная работа студента.
- •Подготовить реферат на тему: «Подагра, возможные причины и клинические проявления».
- •Тема 3. Исследование репликации ДНК и транскрипции РНК.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 4. Биосинтез белка на рибосомах. Исследование процессов инициации, элонгации и терминации в синтезе полипептидной цепи. Ингибиторное действие антибиотиков.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 5. Регуляция экспрессии генов.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 6. Анализ механизмов мутаций, репараций ДНК. Усвоения принципов получения рекомбинантных ДНК, трансгенных белков.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 7. Исследование молекулярно-клеточных механизмов действия гормонов белково-пептидной природы на клетки-мишени. Гормоны гипоталамуса и гипофиза.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 8. Исследование молекулярно-клеточных механизмов действия стероидных гормонов на клетки-мишени. Стероидные гормоны.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 9. Исследование роли тиреоидных гормонов и биогенных аминов в регуляции метаболических процессов.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 10. Гормоны поджелудочной железы. Гормоны пищеварительного тракта.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 11. Гормональная регуляция гомеостаза кальция.
- •Тема 12. Физиологически активные эйкозаноиды.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 13. Исследование процесса переваривания питательных веществ (белков, углеводов) в пищеварительном тракте.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 14. Исследование процесса переваривания питательных веществ (липидов) в пищеварительном тракте.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 15. Исследование функциональной роли жирорастворимых витаминов в метаболизме и реализации клеточных функций.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 16. Исследование белков плазмы крови: белков острой фазы воспаления, собственных и индикаторных белков.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 17. Исследование кислотно-основного состояния крови и дыхательной функции эритроцитов. Патологические формы гемоглобинов.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 18. Исследование азотистого обмена и небелковых азотосодержащих компонентов крови – конечных продуктов катаболизма гема.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 19. Исследование биохимических закономерностей реализации иммунных процессов. Иммунодефицитные состояния.
- •Тема 20. Биохимия печени. Патобиохимия желтух.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •17,1 34,2 51,3 68,4 85,5 102,6 мкмоль/л
- •Тема 22. Исследование нормальных компонентов мочи.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 23. Исследование патологических компонентов мочи.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 24. Биохимия мышц и мышечного сокращения.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 25. Биохимия соединительной ткани.
- •Цель и исходный уровень знаний.
- •Тема 26. Биохимия костной ткани. Факторы риска остеопороза.
- •Тема 27. Биохимия нервной ткани.
- •Цель и начальный уровень знаний.
- •ИТОГОВЫЙ КОНТРОЛЬ УСВОЕНИЯ МОДУЛЯ
- •СОДЕРЖАНИЕ
7. |
АТФ-синтетаза |
7.1. |
Строение |
и |
принципы |
митохондрий. |
|
функционирования АТФ-синтетазы. |
Алгоритм лабораторной работы.
Определение активности цитохромоксидазы – компонента дыхательной цепи
митохондрий.
Принцип метода. Цитохромы – сложные белки гемпротеины, относятся к классу
ферментов – оксидо-редуктаз, собравшиеся во всех животных и растительных клетках. Благодаря тому, что атомы железа в цитохромах легко изменяют свою валентность, цитохромы является компонентами дыхательной цепи митохондрий и
переносчиками электронов от восстановленного убихинона на кислород. В цитохромной системе передавать электроны на кислород может лишь цитохром а-а3 –
цитохромоксидазы в состав которой входит медь.
Метод определения активности цитохромоксидазы основан на способности диметилпарафенилендиаминхлорида (ДПФД) быть донором электронов для цитохрома с. ДПФД неферментативно восстанавливает цитохром с, а сам окисляясь,
превращается в красный пигмент, количественное образование которого является пропорциональным активности цитохромоксидазы митохондрий.
Ход работы. Две пробирки: контрольную и опытную заполняют реактивами по
таблице:
Содержание пробирок |
Пробирка |
|
|
Контрольн |
Опытна |
|
ая |
я |
Фосфатный буфер, рН = 7,4 |
1,0 мл |
1,0 мл |
Раствор цитохрома с |
2 капли |
2 капли |
Суспензия митохондрий |
0,5 мл |
0,5 мл |
Раствор ДПФД |
0,5 мл |
0,5 мл |
Этиловый спирт |
1,0 мл |
--- |
Физраствор |
--- |
1,0 мл |
Инкубация в термостате 5 мин. при 37оС |
|
|
Результаты: появление красной окраски |
|
|
Добавление этилового спирта инактивирует цитохромоксидазу и ферментативное превращение цитохрома с. Пробирки помещают в термостат на 5 минут при 37оС и
наблюдают за появлением красной окраски.
По результатам проведенного эксперимента сделать выводы.
Тема 12. Хемиосмотическая теория окислительного фосфорилирования. Ингибиторы и разобщители окислительного фосфорилирования.
Актуальность темы.
Митохондриальную систему сопряжения окислительных процессов с генерацией
высокоэнергетического интермедиата АТФ, называют окислительным фосфорилированием.
Окислительное фосфорилирование позволяет организму поглощать значительную долю потенциально свободной энергии окисления субстратов. Обоснование
24
механизма окислительного фосфорилирования позволяет сделать хемиосмотическая теория. Окислительное фосфорилирование является очень важным процессом, нарушение его протекания несовместимо с жизнью.
Цель и исходный уровень знаний.
Общая цель.
Изучить хемиосмотическую теорию окислительного фосфорилирования и условия его эффективного протекания.
Конкретные цели:
1.Трактовать роль биохимического окисления, тканевого дыхания и окислительного фосфорилирования в генерации АТФ при аэробных условиях.
2.Анализировать нарушение синтеза АТФ при условиях действия на организм
человека патогенных факторов химического, физического и биологического происхождения.
Исходный уровень знаний-умений: знать особенности гистологического строения митохондрий и основы биоэнергетики тканей.
Ориентировочная карта для самостоятельного изучения студентами учебной литературы при подготовке к занятию.
Содержание |
|
|
и |
Указания к учебным действиям |
|
|||||
последовательность действий |
|
|
|
|
|
|
|
|||
1. |
Практическое |
изучение |
1.1. Исследовать процесс окислительного |
|||||||
процесса |
окислительного |
фосфорилирования |
в |
митохондриях, |
||||||
фосфорилирования |
|
в |
объяснить, на чем он базируется. |
|
||||||
митохондриях. |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
2. |
Хемиосмотическая теория |
2.1. |
|
Электрохимический |
градиент |
|||||
окислительного |
|
|
– |
протонов |
(ΔμН+). |
|
Физико-химические |
|||
фосфорилирования |
|
составляющие электрохимического градиента |
||||||||
молекулярный |
|
механизм |
протонов. |
|
|
|
|
|||
генерации АТФ в |
процессе |
|
|
|
|
|
|
|||
биологического окисления. |
|
|
|
|
|
|
|
|||
3. |
Условия |
эффективного |
3.1. |
Целостность |
митохондриальной |
|||||
сопряжения |
окисления |
и |
мембраны. |
|
|
|
|
|||
фосфорилирования |
|
в |
3.2. Наличие всех компонентов цепи |
|||||||
митохондриях. |
|
|
|
транспорта. |
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
3.3. |
Специфическая |
внутримембранная |
|||
|
|
|
|
|
топография переносчиков. |
|
|
|||
|
|
|
|
|
3.4. |
Наличие достаточного |
количества |
|||
|
|
|
|
|
АДФ и Фн. |
|
|
|
|
|
4. Ингибиторы и разобщители |
4.1. |
Ингибиторы |
транспорта |
электронов |
||||||
тканевого дыхания. |
|
|
(ротинон, амитал, цианиды, СО). |
|
||||||
|
|
|
|
|
4.2. |
|
Разобщители |
окислительного |
||
|
|
|
|
|
фосфорилирования |
|
(2,4-динитрофенол, |
|||
|
|
|
|
|
гормоны щитовидной железы, свободные |
|||||
|
|
|
|
|
жирные кислоты). |
|
|
|
||
|
|
|
|
|
4.3. Нарушение синтеза АТФ в условиях |
|||||
|
|
|
|
|
действия на организм человека патогенных |
|||||
|
|
|
|
|
факторов химического, физического и |
|||||
|
|
|
|
|
биологического происхождения. |
|
25
Индивидуальная самостоятельная работа студентов.
Обзор научной литературы и подготовка реферативных сообщений по темам:
1.Разобщители окислительного фосфорилирования и регуляция термогенеза.
2.Универсальность хемиосмотической теории для живых систем.
Алгоритм лабораторной работы.
Изучение окислительного фосфорилирования в митохондриях и действие разобщителя– 2,4-динитрофенола на этот процесс.
Принцип метода. В процессе окисления разных субстратов и передачи электронов в дыхательной цепи митохондрий освобождается энергия. Часть этой энергии используется для синтеза АТФ в процессе окислительного
фосфорилирования: АДФ + Фн АТФ
В эксперименте, чтобы предотвратить нагромождение АТФ (высокое содержание АТФ ингибирует ферменты дыхательной цепи) в качестве конечного акцептора неорганического фосфата используют глюкозу. Фосфорилирование глюкозы при
участии АТФ катализирует фермент – гексокиназа:
Глюкоза + АТФ АДФ + глюкозо-6-фосфат
Определение неорганического фосфата основано на способности молибдата аммония в кислой среде присоединять остаток фосфорной кислоты с образованием фосфата аммония. Фосфат аммония под действием восстановителя – аскорбиновой кислоты образует продукты окрашенные в синий цвет. В процессе окислительного
фосфорилирования Фн изымается из инкубационной среды, и поэтому интенсивность
синей расцветки раствора уменьшается.
Разобщители – это соединения которые нарушают сопряженность окисления и фосфорилирования в митохондриях. В присутствии разобщителей наблюдается активное поглощение кислорода митохондриями, однако скорость генерации АТФ –
значительно уменьшается (или отсутствует). Согласно хемиосмотической теории,
разобщители вызывают потерю мембраной электрохимического протонного потенциала – движущей силы генерации макроэргических связей АТФ.
Материалы и реактивы: свежевыделенные митохондрии из мышц кроля; смесь № 1 – 0,08 моль КН2РО4, 0,255 моль KCl, 0,05 моль MgCl2 растворяют в
дистиллированной воде, добавляют 0,1 М раствор КОН к рН = 7,4 и доводят объем в
мерной колбе до 1 л; смесь № 2 – водный раствор глюкозы с АТФ, что содержит 90 мг глюкозы и 30 мг АТФ в 1 мл; гексокиназа в 1%-м растворе глюкозы (0,8 мг гексокиназы в 1 мл); 5%-й раствор сукцината калия; 5%-й раствор уксусной кислоты; 10%-й раствор трихлоруксусной кислоты (ТХУ); 1 %-й раствор динитрофенола; 2,5%-й раствор молибдата аммония в 10 М растворе H2SO4 (2,5 г молибдата аммония растворяют в 50 мл 20 М раствора H2SO4 и доводят объем водой до 100 мл); 5%-й раствор
аскорбиновой кислоты.
Ход работы. Три пробирки – контрольную, опытную № 1 та опытную № 2
заполняют реактивами по таблице:
Содержание пробирок |
|
Пробирки |
|
|
Контрол |
Опыт |
|
Опыт |
|
|
ь |
№1 |
|
№2 |
Смесь № 1 |
1,0 мл |
1,0 мл |
|
1,0 мл |
Смесь № 2 |
0,5 мл |
0,5 мл |
|
0,5 мл |
Гексокиназа |
0,5 мл |
0,5 мл |
|
0,5 мл |
Сукцинат калия |
0,5 мл |
0,5 мл |
|
0,5 мл |
26